Молодежное правительство Костромской области второго созыва начало свою работу  с января 2009 года в соответствии с распоряжением губернатора Костромской области от 21.01.2009 г. № 47-р «О составе Молодежного правительства Костромской области второго созыва».

Президентом Российской Федерации 2009 год был объявлен Годом молодежи. Елена Банникова – заместитель председателя Молодежного правительства по социальным вопросам была руководителем Штаба реализации Года молодежи в Костромской области. Главной задачей Штаба было максимальное вовлечение молодежи в участие областных мероприятиях, конкурсах, организацию социальных акций.

Руководящий состав принимал участие в оперативных совещаниях при губернаторе области, еженедельно проходили заседания кабинета Министров, было проведено 7 заседаний Молодежного правительства, члены Молодежного правительства участвовали в совете по инвестициям и бюджетной комиссии Костромской области, коллегиях исполнительных органов государственной власти Костромской области:
комитета по делам молодежи,
департамента образования и науки,
департамента здравоохранения,
департамента государственной службы занятости населения,
департамента агропромышленного комплекса;
в заседании конкурсной комиссии по формированию кадрового резерва управления государственной службы и организационной работой администрации области; рабочем совещании с молодыми депутатами и представителями молодежных правительств субъектов Российской Федерации; рабочей группе по переименованию улиц, бульваров, площадей г. Костромы, участвовали в подготовке II туристского форума Кострома – Roadshow, работали в Общественном духовном совете по защите детей и молодежи от алкогольной угрозы.

Члены Молодежного правительства Костромской области второго созыва с начала 2009 г. активно включились в акцию по повышению электоральной активности молодых избирателей «Гражданская инициатива», в частности работали в молодежном предвыборном Штабе по повышению активности молодых избирателей на выборах мэра г. Костромы в январе 2009 г.

Команда Молодежного правительства приняла участие в Фестивале-конкурсе снежно-ледовых скульптур «Кострома - Зимняя сказка», проводимом администрацией г. Костромы и была награждена дипломом за яркий художественный образ.

В феврале 2009 года впервые в Костромской области стартовал Молодежный образовательный форум «Патриот-2009». Молодежное правительство было задействовано в организации и проведении форума, принимали участие в разработке образовательной программы форума. Беляева Ольга – региональный руководитель проекта «Ы-ТВ» организовала молодежную теле-студию, где ребята занимались съемкой новостных репортажей форума, выпускали молодежную газету. На форуме сформировался кадровый актив Молодежного правительства (18 человек), для которого была разработана и проведена образовательная программа.

Участники Молодежного правительства первого созыва и авторы лучших проектов, рекомендованных губернатором к внедрению, продолжили реализацию своих идей в 2009 году:
Екатерина Субботина включила свой бизнес-план предприятия по переработке продукции пчеловодства «Волшебный улей» в концепцию развития пчеловодства в Костромской области;
с марта 2009 года был запущен проект Николая Серого «Виртуальная историко-культурная энциклопедия Костромского края».  Сайт работает по адресу www.kosgrad.narod.ru.

Молодежное правительство установило партнерские связи с Молодежной общественной палатой при Думе Костромской области, с активами высших и средних специальных учебных заведений г. Костромы, обществом слепых г. Костромы, областным комитетом Российского союза молодежи. Совместно с Молодежной общественной палатой при Костромской областной Думе, службами занятости учебных заведений  было проведено заседание дискуссионного клуба по вопросам трудоустройства и занятости молодежи.

В апреле 2009 года совместно с обществом слепых г. Костромы проведен круглый стол на тему «Проблемы молодых инвалидов по зрению и пути их решения». Члены Молодежного правительства провели игру «Что? Где? Когда?» в областной библиотеке для слабовидящих молодых людей.

Участники Молодежного правительства участвовали в экспертизе конкурсных материалов участников 12-й областной научной конференции молодых исследователей «Шаг в будущее», в экспертном совете областного конкурса «Об учреждении грантов лучшим учителям Костромской области», работали в экспертном совете областного конкурса «Костромской край без табака»; участвовали в работе Комиссии по делам безработных граждан (подготовка проектов решений Комиссии) департамента занятости.

23 апреля 2009 года Макарова Татьяна и Серый Николай приняли участие во Всероссийском Съезде молодежных правительств субъектов РФ, где презентовали работу правительства и проекты. Костромское Молодежное правительство входит в Ассоциацию Молодежных Правительств России с июня 2008 года. На сайте Ассоциации www.molprav.ru имеется страничка правительства Костромской области, где выкладываются главные новости.

Участники Молодежного правительства были в числе организаторов и участников областных мероприятий: Широкая Масленица, митинг на 1 мая, мероприятия, посвященные празднованию Победы в Великой Отечественной войне, были организаторами и участниками акции по сдаче крови «Служба крови»; празднование 65-летия Костромской области.

Молодежное правительство участвовало в подготовке и проведении благотворительного концерта для детей и подростков «Весеннее настроение», приуроченного к Дню защиты детей, который состоялся 23 мая 2009 года в КВЦ «Губернский».

9 июня 2009 года состоялась защита проектов членов Молодежного правительства при экспертном совете, состоявшем из представителей исполнительных органов государственной власти. Было представлено 6 проектов:
«Развитие пчеловодства в Костромской области» (Субботина Е.А.), проект включен в концепцию развития пчеловодства в Костромской области;
«Информирование учащихся школ о состоянии рынка труда» (Курдюмов А.В.), наработки проекта легли в основу работы службы «Молодежное трудоустройство» ГУ «Областной центр патриотического воспитания молодежи»;
«Виртуальный музей Победы Костромской области» (Шабуров В.С.) реализуется областным комитетом Российского союза молодежи;
«Туристический маршрут «Купеческой тропой» (Серый Н.И.), проект рекомендовано доработать;
«День повышения финансовой грамотности» (Смирнова О.В., Полякова А.В.), проект был реализован в рамках проведения Дня финансовой грамотности для студентов Костромской сельскохозяйственной академии и Костромского государственного технологического университета;
«Обращение с твердыми бытовыми отходами 2009» (Керимов Р.Ф.), проект выиграл грант в 10 тыс. рублей на областном Конкурсе молодежных инновационных проектов и представлен на участие в Федеральном конкурсе молодежных инновационных проектов «Зворыкинская премия».

В июле 2009 года участники Молодежного правительства приняли активное участие в подготовке и проведении летнего Молодежного образовательного лагеря «Патриот 2009»: ребята выступили организаторами альтернативных площадок, отвечали за встречу и сопровождение преподавателей, экспертов, гостей форума. Макарова Татьяна подготовила проведение в рамках форума тематического Дня семьи: были приглашены специалисты департаментов здравоохранения и социальной защиты населения, опеки и попечительства и их подведомственных учреждений.

В качестве инструкторов-руководителей групп 3 участника правительства работали на Всероссийском образовательном форуме «Селигер 2009» в Тверской области.

Активисты Молодежного правительства выступили организаторами областных социальных акций:
с 13-24 августа 2009 г. были организаторами фотовыставки «Костромской край без табака» в рамках информационно-пропагандистской, оздоровительной акции «Волна здоровья»!;
совместно с департаментом социальной защиты населения, опеки и попечительства Костромской области приняли участие в проведении социальной  акции «Соберем ребенка в школу!»;
в рамках областной благотворительной акции «Подари ребенку Новый год!» Молодежное правительство приняло участие в организации и проведении 26 декабря 2009 г. во Дворце творчества детей и молодежи для детей из учреждений социальной защиты новогоднего праздничного мероприятия «Новогодняя елка».

По итогам работы Молодежного правительства в 2009 г. на конкурсной основе или из кадрового резерва государственной гражданской службы в исполнительные органы государственной власти и их подведомственные учреждения было трудоустроено 7 человек.

По инициативе членов Молодежного правительства были внесены изменения в структуру правительства, сокращен его состав, приоритетным направлением работы правительства определено развитие туристической сферы Костромской области. 16 марта 2010 г. было принято постановление администрации Костромской области «О Молодежном правительстве Костромской области» № 76- а.